Este trabajo centro su interes en evaluar en epoca lluviosa y en periodo seco la concentracion de elementos mayores (Na, K, Ca, Mg) y de metales pesados (Cd, Cr, Pb, Hg), en las aguas y sedimentos del rio Magdalena, considerado como la mas importante arteria fluvial de Colombia. La cuantificacion de estas entidades quimicas se realizo a traves de espectroscopia de absorcion atomica. Un analisis por cromatografia de gases acoplada a espectrometria de masas sirvio para reconocer la presencia de pesticidas organoclorados en dichas matrices del rio, en su paso por los municipios de Purificacion, Flandes, Ambalema y Honda, considerados como de mayor importancia pesquera en eldepartamento del Tolima. Se encontro que los atributos de calidad y contaminacion del agua en todos los puntos muestreados evidenciaron un agua poco recomendable para el consumo humano, al plomo como el mayor contaminante de estas, al indice de contaminacion por solidos suspendidos (ICOSUS) como el indicador de contaminacion de mayor relevancia en Flandes, Ambalema y Honda. Los sedimentos del rio deben ser tenidos en cuenta como grandes reservorios de informacion de la calidad del cuerpo de agua. Esta investigacion se convierte en un punto de apoyo importante para posteriores estudios sobre monitoreo, biorremediacion y toma de medidas integrales para la proteccion ambiental del rio Magdalena.