Este estudio se realizo en la Microcuenca “El Pencil” ubicada en el municipio de Filandia – Quindio, durante el segundo semestre del 2005. Las aguas de dicha fuente son usadas para riego agricola, por tal motivo, fue necesario diagnosticar la calidad ambiental de las mismas a traves de algunos parametros fisicoquimicos, bacteriologicos, Biologicos (Macroinvertebrados acuaticos) y pruebas cromatograficas para detectar la residualidad de pesticidas organoclorados. Los resultados muestran que la comunidad de macro invertebrados de la microcuenca El Pencil esta representada por 8 clases, 14 ordenes, 39 familias y 750 individuos colectados. Los valores del indice (H´) oscilaron entre 1.0 a 3.0 (Bits/ind) lo cual indica que esta comunidad acuatica presento una baja diversidad. Mientras el indice biotico BMWP/Col. califico la calidad de estas aguas como de buenas a ligeramente contaminadas. Por suparte, los analisis cromato graficos indicaron la presencia de 10 pesticidas organoclorados con concentraciones que superan los 0.0001 (mg/ml) que establece el decreto 475/84; aunque, los valores de los analisis fisicoquimicos y bacteriologicos segun el mismo decreto y el 475/98, catalogan el agua de esta micro-cuenca como apta para uso agricola. No obstantesi se continua con el manejo inapropiado de agroquimicos y de malas practicas agricolas y pecuarias, dicha fuente podria deteriorarse.