El rio Ovejas es uno de los principales tributarios del alto rio Cauca, su cuenca drena una area aproximada de 947 Km y confluye al rio Cauca tres y medio kilometros aguas abajo del embalse La Salvajina a una altitud de 1.000 msnm. Durante Octubre de 2008 y Septiembre de 2009, se colectaron mensualmente en tres (3) tramos o estaciones de Muestreo, Macroinvertebrados Acuaticos Epicontinentales (MAE), se realizaron mediciones de parametros fisico-quimicos hidricos y el comportamiento de los caudales. Los tramos de muestreo fueron seleccionados, teniendo en cuenta las posibilidades de impactos del proyecto de trasvase para conducir el rio Ovejas al embalse La Salvajina, con el fin de incrementar la capacidad de generacion hidroenergetica. Se determino la estructura de la comunidad de macroinvertebrados por sitio y por epoca de estudio. Con base en los resultados, se concluye que el rio Ovejas a pesar de estar impactado por actividades antropicas en su cuenca alta y media, el trayecto de cuenca baja objeto del estudio presenta caracteristicas fisicoquimicas y biologicas normales de un cuerpo de agua natural y no revela condiciones que puedan afectar el desarrollo de la biota acuatica en general. La variable que influye sobre la estructura de la comunidad de macroinvertebrados es la epoca, ya que las condiciones fisico-quimicas hidricas del rio no tuvieron cambios importantes. Los resultados de calidad biologica aplicando el BMWP y diversidad de Shannon Weaver, permiten determinar que existe una correspondencia entre estos parametros y las caracteristicas fisico-quimicos del sistema.