Se establecio la distribucion potencial de Trichechus manatus manatus y Caiman crocodilus fuscus en diferentes sistemas acuaticos como cienagas, humedales, canos y tributarios asociados a la cuenca media y baja del rio Atrato a traves de la consecucion de los registros directos e indirectos para estas dos especies de vertebrados acuaticos, identificando a su vez las amenazas de tipo ambiental y antropico a las que se encuentran sometidas estas especies y los ecosistemas acuaticos donde habitan. Esta informacion permitio establecer el grado de conservacion de las poblaciones identificando la caceria selectiva y dirigida como la principal amenaza. Se confirmo la distribucion del manati antillano Trichechus manatus para la cuenca del rio Atrato, a traves de los registros obtenidos y la incidencia de los periodos hidroclimaticos en su distribucion. Finalmente se registro la explotacion directa de babillas juveniles y sub-adultas como recurso a nivel silvestre por parte de la comunidad, lo cual esta generando una disminucion paulatina de la cantidad de individuos reproductores. La participacion de las comunidades de pescadores y habitantes locales en las areas de estudio permitio la ubicacion de los registros directos e indirectos de las especies generando de esta forma estrategias participativas de investigacion en una de las regiones mas biodiversas del mundo.