Antecedentes: la teoria de sistemas dinamicos y la geometria fractal han sido de utilidad para la evaluacion de la dinamica cardiaca de adultos y neonatos. Recientemente, desde esta perspectiva, se desarrollo un metodo diagnostico de la dinamica caotica cardiaca neonatal. Objetivo: confirmar la capacidad diagnostica de esta metodologia para diferenciar registros cardiacos neonatales normales y con enfermedades cardiacas, mediante un estudio ciego. Metodos: se tomaron 59 registros cardiacos neonatales: 10 con diagnosticos normales y 49 con diferentes enfermedades cardiacas. Se enmascararon los diagnosticos convencionales y se tomaron las frecuencias cardiacas maximas y minimas cada hora, y el numero de latidos/hora durante 21 horas. Para cada dinamica se desarrollaron simulaciones de la totalidad de la secuencia de frecuencias cardiacas, y se generaron atractores; seguidamente, se calculo su dimension fractal y se cuantificaron sus espacios de ocupacion en el espacio fractal de Box Counting, determinando su diagnostico fisico-matematico. Resultados: las dimensiones fractales no permiten diferenciar normalidad de enfermedad. En contraposicion, mediante los espacios de ocupacion de los atractores caoticos hallados, se logro diferenciar estados de normalidad de enfermedades agudas para lograr una sensibilidad y especificidad de 100 %, asi como un coeficiente Kappa de 1. Conclusiones: se comprueba la capacidad diagnostica a nivel clinico de la metodologia desarrollada, y se revela la existencia de una autoorganizacion acausal de la dinamica cardiaca neonatal, que permite establecer diferencias entre normalidad y enfermedad, con aplicabilidad clinica de caracter preventivo.