Debido al incremento exponencial de la informacion almacenada en las organizaciones, la Sociedad de la Informacion esta siendo superada por la necesidad de nuevos metodos capaces de procesar la informacion y asegurar su uso productivo. Esto se hace logicamente extensible a los centros hospitalarios, a partir del uso extendido de las Historias Clinicas en formato electronico. Disponer de informacion sistematizada, gestionarla de forma eficiente y segura es esencial para garantizar mejores practicas en salud. A esto se le anade la necesidad de soportar estandares que permitan el intercambio entre las instituciones de salud; especificamente HL7 se ha convertido en uno de los mas utilizados debido a que proporciona el intercambio a partir del metalenguaje XML. En este trabajo se propone una metodologia para el descubrimiento de conocimiento implicito en Historias Clinicas en formato semi-estructurado utilizando el contenido y la estructura de los mismos. Los principales resultados son: (1) La metodologia para el agrupamiento de Historias Clinicas; (2) La interpretacion de los resultados del agrupamiento para asistir la toma de decisiones diagnosticas; (3) La implementacion del estandar HL7, para la manipulacion de documentos medicos a partir de CDA. Palabras Clave: agrupamiento, descubrimiento de Conocimiento, HCE, XML, CDA.