Introduccion. La aparicion de reacciones adversas a medicamentos es un tema relevante debido a la escasez de datos sobre la seguridad de los medicamentos en la poblacion neonatal. Objetivo. Determinar el comportamiento de las reacciones adversas a medicamentos en neonatos hospitalizados en dos servicios de neonatologia de Barranquilla, Colombia. Materiales y metodos. Se hizo un estudio descriptivo, prospectivo y de corte transversal de periodo de farmacovigilancia intensiva centrada en el paciente. El seguimiento y la vigilancia de la aparicion de reacciones adversas a medicamentos en neonatos se extendieron durante seis meses. Se utilizaron el algoritmo de Naranjo para evaluar la causalidad, la escala modificada de Hartwig y Siegel para establecer la gravedad y los criterios de Schumock y Thornton para determinar la posibilidad de evitarlas. Resultados. De los 284 pacientes en seguimiento, se detectaron 123 reacciones adversas en 78 neonatos, es decir, una incidencia de 27,4 % (78/284); la densidad de la incidencia fue de 30,60 reacciones adversas por 1.000 pacientes por dia (78/2.549). El sistema organico mas afectado fue el digestivo (33,6 %); los antibioticos sistemicos fueron los mas implicados en las reacciones adversas. La mayoria de estas fueron leves (58,5 %), el 83 % se clasificaron como probables, el 16,2 %, como posibles, y el 0,8 %, como definitivas. Conclusiones. La incidencia de las reacciones adversas a medicamentos en neonatos fue alta, especialmente en los pacientes prematuros (menos de 38 semanas).