Introduccion: las amebas de vida libre (AVL) han sido aisladas de habitat incluyendo: agua, suelo y vegetacion. Los cambios ecologicos y la incursion de estos habitats, han hecho que puedan invadir un hospedero y vivir como parasitos dentro de el. Por esto, las especies de los generos Acanthamoeba y Naegleria han sido asociadas con infecciones oportunistas. Objetivo: evaluar la presencia de las amebas de vida libre en fuentes de agua natural en el municipio de Turbaco, con el fin de que sean consideradas en la conducta diagnostica y terapeutica por las entidades de salud pertinentes. Metodos: se realizo un estudio descriptivo, transversal en los arroyos Matute, Mameyal y Cucuman del municipio de Turbaco - Bolivar. La identificacion se hizo mediante el estudio de los frescos de las fuentes de agua observando caracteristicas morfologicas de las amebas. Resultados: de un total de 54 muestras se obtuvo una positividad del 55,5 % para una o mas AVL. Con mayor frecuencia Naegleria sp con un 44,4 % y Acanthamoeba sp , en un 7,4 %. Ademas, se encontraron otros microorganismos responsables de parasitosis intestinales como: Giardia intestinalis , Blastocystis hominis y Retortomonas intestinalis. Conclusion: los arroyos estudiados son habitat de las AVL, demostrando que estan presentes en el ambiente y que son frecuentes en zonas donde el ser humano suele practicar ciertas actividades, sin embargo, la proporcion de Naegleria sp. permite alertar aun mas a la poblacion puesto que esta ameba puede afectar a todo tipo de individuo independiente de su estado inmunologico.