En el presente trabajo se muestra la construccion, desarrollo y aplicacion de unidades didacticas innovadoras abordando conceptos estructurantes como naturaleza corpuscular de la materia, cambio quimico y cuantificacion de relaciones, orientadas por un eje didactico de resolucion de problemas teniendo en cuenta los estandares curriculares nacionales y concepciones cientificas de interaccion. Las unidades didacticas derivadas de la conjugacion de estas perspectivas cientificas y educativas fueron aplicadas con estudiantes de educacion media de varios Colegios de la ciudad de Bogota.