RESUMEN Los microsatelites o STR por su sigla en ingles ( Short Tandem Repeat ) son repeticionesde secuencias cortas de nucleotidos a traves del DNA, de gran importancia debido asu caracter polimorfico que permite su utilizacion en la identificacion genetica deindividuos o poblacionales. En este trabajo se investigaron los perfiles geneticos deuna muestra de poblaciones humanas del altiplano cundiboyacense en Colombia; seusaron los marcadores STR’s D2S1338, D19S433, PENTA D, PENTA E y SE-33. Estoscinco STR’s fueron amplificados mediante reaccion en cadena de la polimerasa(PCR), corridos con electroforesis capilar, y tipificados con los programas Genscan yGenotyper. Como resultado se reportan las frecuencias alelicas de los cinco micro-satelites (no reportados anteriormente para esta region). Se encontro que los lociD19S433 y SE-33 no estan en equilibrio de Hardy-Weinberg; y que el Penta E tiene elmayor poder de discriminacion. La distribucion de las frecuencias alelicas para loscinco marcadores, en las dos poblaciones analizadas mostro que no existen diferen-cias estadisticas significativas entre ellas.