RESUMEN La determinacion del sexo en plantas de papaya es considerado un sistema intrigante, debido a que esta especie presenta tres sexos (macho, hembra y hermafrodita) determinados por un locus multialelico. Ademas, esta especie no presenta cromosomas sexuales morfologicamente diferenciables. Los marcadores moleculares pueden asociarse a caracteristicas de interes, como en el presente caso, al sexo en plantulas de papaya. Con el objetivo de identificar marcadores moleculares que permitan una rapida identificacion del sexo en genotipos colombianos de plantulas de papaya, se aplico la tecnica RAPD (amplificacion aleatoria de polimorfismos del ADN). El estudio encontro tres marcadores RAPD polimorficos, los cuales permitieron diferenciar los sexos de la papaya. Dos marcadores fueron especificos para plantas macho y hermafrodita, y un tercero para plantas hembra. Estos nuevos marcadores moleculares podran ser beneficiosos en la determinacion del sexo en genotipos colombianos de papaya. Sex definition in papaya is considered an intriguing system, due to the fact that the plant presents three different sexes (male, female and hermaphrodite), which are determined on a multiallelic locus. Moreover, the plant does not have morphologically differentiated sexual chromosomes. Provided that molecular markers can be associated to traits of interest, in the present study they were applied to rapid sex identification in seedlings of Colombian papaya genotypes. With the aim of finding such markers, an RAPD technique (Randomly Amplified Polymorphic DNA) was applied. The study allowed identifying three polymorphic RAPD markers apt for differentiating the sexes in papaya. Two of them are specific for male and hermaphrodite plants, and one for female plants. These novel molecular markers will be valuable for sex determination in Colombian genotypes of papaya.