El objetivo de este trabajo fue determinar la estructura y composicion de los ensamblajes de murcielagos en los alrededores de la Estacion Meteorologica Primates (Coloso) y finca “La Flojera” (Sincelejo), en el departamento de Sucre, Colombia; desde junio de 2011 hasta marzo de 2012. La captura de los murcielagos se realizo con redes de niebla, activas entre las 18:00 a 24:00 h. Se capturaron 427 murcielagos pertenecientes a 26 especies, 17 generos, seis subfamilias y cuatro familias taxonomicas. La familia Phyllostomidae fue la de mayor diversidad, con 20 especies y el 97.9% de todos los individuos capturados. Artibeus planirostris fue la especie mas abundante con 139 individuos, luego Phyllostomus discolor con 56, Desmodus rotundus y Sturnira lilium, ambas con 37 individuos. De acuerdo con los estimadores de riqueza utilizados, la eficiencia del muestreo oscilo entre un 80 y 90%. Al considerar las categorias troficas, los murcielagos frugivoros presentaron la mayor riqueza de especies (42.3%). El valor de diversidad de Shannon-Wiener (H’) obtenido para la zona 1 (Coloso) fue de 2.4 y para la zona 2 (Sincelejo), de 2.0. La dominancia presento su mayor valor (0.85) en la estacion Primates. El analisis de similitud entre comunidades a traves del indice cualitativo de Jaccard fue de 0.53. Las diferencias encontradas en ambas zonas pueden estar asociadas a las diferencias en la vegetacion