Las cianotoxinas son producidas por cianobacterias e incluyen las microcistinas, consideradas como las toxinas cianobacteriales (hepatotoxinas) mas comunes. Niveles elevados de microcistinas pueden persistir en el ambiente durante varios dias, lo que significa un riesgo para la salud y un reto para la gestion del servicio publico. En este estudio se evaluo el efecto de la interaccion entre la microcistina-LR (MC-LR) procedente de un florecimiento cianobacterial y el sedimento obtenido del embalse Riogrande II (Antioquia). Se observo una disminucion de la concentracion de microcistina-LR hasta niveles inferiores al limite de deteccion en presencia del sedimento. En muestras de agua sin sedimento la concentracion de MC-LR se mantuvo constante (5.0 ± 0.1 μg/mL). Estos resultados se atribuyen a una posible adsorcion por materiales solidos o a la degradacion de la MC-LR por accion biologica o quimica. Ademas, los datos indican que los sedimentos juegan un rol en la degradacion de microcistinas en sistemas de agua dulce, proporcionando informacion importante que puede ser aplicada en estrategias de gestion para el mejoramiento de la calidad del agua.