Con el fin de evaluar algunos marcadores de dano genetico en peces de importancia comercial del rio Magdalena (Colombia), se colectaron ejemplares de Prochilodus magdalenae (Bocachico) y Pimelodusblochii (Nicuro) en los municipios de Purificacion, Flandes, Ambalema y Honda, puertos localizados en el departamento de Tolima. Se tomaron muestras de sangre de los ejemplares mediante puncion cardiaca, para la determinacion de eritrocitos micronucleados (EMN) y de quiebres en el ADN (a traves del ensayo cometa o electroforesis alcalina de celulas individuales). Los resultados obtenidos fueron ademas analizados buscando si existia correlacion con los niveles de algunos metales pesados (Pb, Cd y Ni) determinados en el agua y los sedimentos en los mismos sitios donde se realizaron las capturas.Pese a que se evidenciaron dificultades para establecer la relacion in vivo de estos contaminantes ambientales con respecto a los efectos genotoxicos inducidos en los peces, en las especies estudiadas se logro observar efectos genotoxicos representados por la presencia de Eritrocitos Micronucleados (EMN) y la formacion de los cometas, lo que de acuerdo con la frecuencia de formacion y su longitud, representa un dano bajo sobre el ADN.Estos resultados son significativos para establecer la presencia de efectos negativos sobre los recursos icticos, atribuidos a la alta descarga de contaminantes de origen industrial, agricola y minero, entre otras, considerados como potenciales agentes mutagenicos.