Resumen En comparacion con los ecosistemas acuaticos de zonas templadas, los lagos de inundacion tropicales son sistemas altamente complejos, numerosos pero poco conocidos. Esta investigacion evaluo la variacion de la produccion primaria y la biomasa fitoplanctonica en una estacion en la cienaga Escobillitas del complejo cenagoso de Ayapel, ubicado al norte de Colombia. Se presento variacion de la produccion primaria en relacion con el pulso de inundacion, ya que esta oscilo entre 0 (aguas altas en ascenso 2007) y 191.6 mgC m -2 d -1 (aguas altas en descenso 2007) con un valor medio de 108.6 mgC m -2 d -1 . Se encontro la mayor produccion primaria bruta en aguas altas en descenso, condicion acompanada por un mayor registro de biomasa algal, reduccion en la eficiencia fotosintetica, bajos valores de respiracion y de las relaciones P/B y P/R. Entre ciclos hidrologicos consecutivos se presenta variacion de los patrones de produccion primaria, ya que para la fase de aguas altas en ascenso, en el 2006 se presento una baja biomasa, con una alta PPB, acompanados de la mayor eficiencia fotosintetica y altos valores de la respiracion, En contraste, para el mismo periodo hidrologico del pulso de inundacion pero en el ano 2007, se presento un aumento de la biomasa, reduccion de la PPB, de la eficiencia fotosintetica, de la relacion P/B y de la respiracion. El sistema acuatico oscila entre euproductivo y oligoproductivo, lo cual es indicador de una alta dinamica trofica.