RESUMEN Los metabolitos secundarios producidos por las plantas estan involucrados en una multitud de interacciones ecologicas, entre ellas las interacciones planta-planta, planta-microorganismos, planta-animales y planta-insectos. Ademas de protegerlas de algunos patogenos, tambien ayudan a las plantas a sobrevivir en condiciones medioambientales adversas. Dadas sus caracteristicas medicinales e industriales, dichos metabolitos tambien son de gran importancia para el ser humano. Sin embargo, el estudio de estos compuestos en plantas tropicales a nivel bioquimico, molecular y genetico, es aun limitado. Dentro de las estrategias de bioprospeccion de la diversidad de muchos paises tropicales como Colombia, la exploracion y explotacion del metabolismo secundario de plantas constituye un reglon importante. En el presente trabajo se reporta una metodologia experimental basada en el aislamiento de ADN genomico de plantas colectadas en campo, y el uso de cebadores degenerados empleados en la amplificacion en cadena de la polimerasa (PCR) para identificar genes que codifican enzimas decarboxilasas dependientes de piridoxal. Estas enzimas estan involucradas en la via metabolica para la sintesis de alcaloides. Basados en la homologia de secuencias reportadas en las bases de datos, se disenaron cebadores degenerados para amplificar secuencias conservadas de estas enzimas en 18 familias de plantas diferentes. Se obtuvieron seis secuencias obtenidas de plantas del genero Piper sp. Este reporte demuestra el potencial uso de esta y otras metodologias actuales para aumentar el conocimiento, entendimiento y exploracion del metabolismo secundario de las plantas de Colombia.