La Pudricion del cogollo (PC), es una de las enfermedades mas limitante para la produccion de Palma de aceite, no solo en Colombia, sino tambien en paises vecinos. Los estudios orientados a la identificacion del agente causal de la misma por casi 50 anos no habian llevado a resultados concluyentes. En este trabajo se presentan los avances de las investigaciones que permitieron resolver esta incognita y orientar una serie de actividades para su manejo y control. El aislamiento del Phytophthora se logro utilizando como trampa, frutos que fueron inoculados con tejido de palmas que mostraban sintomas en estados tempranos de infeccion. Se uso el tejido ubicado en el frente de avance de la lesion. Una vez se observo el desarrollo del patogeno en los frutos se paso a medios selectivos y no selectivos, con o sin antibioticos o fungicidas, para limitar el crecimiento de los hongos y bacterias oportunistas que siempre se presentan en este proceso. Con los cultivos puros obtenidos se realizaron estudios morfologicos y moleculares de Phytophthora sp. , y pruebas de patogenicidad en palmas de vivero e inoculaciones en condiciones in vitro de flechas inmaduras obtenidas a partir de palmas sanas de menos de un ano de edad. Los aislamientos de Phytophthora presentaron en Agar-avena, micelio de color blanco, deprimido con abundantes esporangios papilados, elipsoides, con pedicelo corto, con un tamano promedio de 37,1 ?m x 52,8 m. El diametro promedio de las clamidosporas, que se encontraron frecuentemente en el frente de avance de la infeccion fue 42,4 m. El ADN de los aislamientos fue utilizado para amplificacion por PCR, mediante los iniciadores ITS1/ITS4. El analisis Blason de las secuencias (Accesion No. GQ398157 en el General) mostro una homologia superior al 99,9%.