La acreditacion es el reconocimiento de alta calidad de los programas academicos de las Instituciones de Educacion Superior. Uno de los primeros pasos para iniciar la acreditacion consiste en ponderar los factores. El metodo que se utilice debe reflejar los niveles de importancia de los factores para juzgar la calidad total de los programas. La complejidad en la ponderacion de los factores se origina en las interacciones de juicios entre directivos, profesores, egresados y estudiantes que podrian conllevar a altas inconsistencias en la ponderacion. En esta investigacion se propone la aplicacion de la Teoria de decision multicriterio discreta para ponderar factores dentro de unos niveles de inconsistencia aceptables. Se presentan resultados en la ponderacion de factores para la acreditacion de alta calidad en una facultad de ingenieria, utilizando una herramienta cuantitativa.