Con el fin de realizar un analisis del nivel de contaminacion microbiologica y de las principales fuentes de contaminacion en la Bahia de Santa Marta (BSM), se colectaron muestras de agua para medir las concentraciones de coliformes totales y fecales en 11 estaciones y dos niveles de profundidad (1 y 20 m). Para la epoca de mayores precipitaciones se encontraron altos valores de coliformes totales y fecales, en los dos niveles de profundidad; presentandose una condicion similar para la epoca seca. Con base a una escala conceptual se obtuvo que la BSM presenta un grado de contaminacion medio para actividades de contacto primario (natacion y buceo), sin embargo, existen varias fuentes de contaminacion (emisario submarino, rio, puerto maritimo, entre otras) que estan generando un alto impacto sobre este ecosistema. Los altos valores de contaminacion que se registran en la BSM se encuentran asociados a la proximidad que tiene esta a las zonas urbanas.