Understanding biogeochemical cycles and especially carbon budgets is clue to validate global change models in the present and near future. As a consequence, sinks and sources of carbon in the world are being studied. One of those sinks is the non-well known behavior of the planet vegetation which involves the processes of photosynthesis and respiration. Carbon sequestration rates are highly related to the transpiration through a molecular diffusion process occurring at the stomatal level which can be recorded by an eddy covariance micrometeorological station. This paper explores annual and diurnal cycles of latent heat (LE) and CO2 net (FC) fluxes over 6 different ecosystems. Based on the physics of the transpiration process, different time-scale analysis are performed, finding a near-linear relation between LE and CO2 net fluxes, which is stronger at the more vegetated areas. The North American monsoon season increases carbon up taking and LE-CO2 flux relation preserves at different time scales analysis (hours to days to months). Resumen: El conocimiento de los ciclos biogeoquimicos y, en especial, de los balances de carbono es clave para la validacion de los modelos de cambio global para el presente y el futuro cercano. Como consecuencia, en el mundo se estudian las fuentes y los sumideros de carbono. Uno de esos sumideros es la vegetacion del planeta, que involucra los procesos de respiracion y fotosintesis y cuyo comportamiento se empieza a estudiar. Las tasas de captura del carbono estan muy ligadas a la transpiracion mediante un proceso de difusion molecular en los estomas, que puede registrarse por un sistema micrometeorologico de eddy covarianza. Este articulo explora los ciclos anuales y diurnos de los flujos netos de CO2 y calor latente de seis ecosistemas diferentes. Se desarrollan diversos analisis de escala temporal, basados en la fisica de la transpiracion, y se halla una relacion cuasilineal entre los flujos netos de calor latente y CO2, mas fuerte en las areas con mayor cobertura vegetal. La temporada del monzon norteamericano incrementa la captura de carbono y la relacion entre la evapotranspiracion y el intercambio de gas carbonico se mantiene en las diferentes escalas temporales analizadas (horas, dias, meses).