ImpactU Versión 3.11.2 Última actualización: Interfaz de Usuario: 16/10/2025 Base de Datos: 29/08/2025 Hecho en Colombia
Estudio de las relaciones secuencia - estructura secundaria - función, en moléculas de ARN de transferencia por medio del análisis termodinámico e informático de plegamientos subóptimos
La teoria coevolutiva del codigo genetico de Wong senala que la asignacion de los codones es historicamente dependiente de la relacion aminoacido precursor/aminoacido derivado, como resultado coevolutivo entre las vias biosinteticas de los aminoacidos y los ARNts. Asumiendo que la seleccion natural favorece las estructuras funcionales mas estables y restringidas, aqui se estudio si la plasticidad estructural del ARN mostraba diferencias entre ARNts precursores y derivados. Para el analisis se utilizaron secuencias de ARNt pertenecientes a los dominios Archaea y Bacteria, con el fin de estudiar los repertorios plasticos o conjuntos de estructuras suboptimas. El analisis de formas abstractas permitio agrupar las estructuras secundarias de acuerdo con patrones de anidamiento de helices y adyacencia, e inferir una secuencia consenso a partir de las formas que se ajustaban a la estructura de hoja de trebol. Los repertorios plasticos se generaron a partir de las secuencias consenso. Las comparaciones entre repertorios se basaron en el numero de estructuras, la termoestabilidad de la estructura de minima energia libre y dos parametros estructurales (propension de apareamiento de bases (P) y longitud promedio de las regiones de tallo de doble helice (S)) medidos en cada estructura secundaria. No se encontraron patrones concluyentes en el dominio Bacteria. El dominio Archaea mostro que los ARNt derivados tenian menor numero de formas y mayor termoestabilidad y parametros estructurales que los ARNt precursores, evidencias que estan en acuerdo con la teoria coevolutiva del codigo genetico.