Existe evidencia que indica que algunos cultivares de maiz colombianos poseen contenidos de aceite similares a germoplasmas elite conocidos. Para conocer su uso potencial en las industrias del aceite y de los concentrados animales, y como base para programas de mejoramiento vegetal, es preciso analizar el germoplasma disponible mediante estudios geneticos y fenotipicos. A tal fin se evaluo la diversidad genetica y el contenido de aceite de 22 genotipos de maiz que incluyeron cultivares criollos colombianos y germoplasma elite; la caracterizacion molecular se llevo a cabo con marcadores del tipo microsatelites ( Simple Sequence Repeats , SSR) y analisis bioquimico. Los resultados de este estudio mostraron amplia variabilidad genetica entre los genotipos, lo cual podria representar un potencial de uso en programas de mejoramiento, especialmente por las altas probabilidades de encontrar heterosis. Asi mismo, la evaluacion bioquimica permitio identificar aquellos materiales con los mayores contenidos de aceite, los cuales fueron evaluados adicionalmente para el perfil de acidos grasos. Los resultados del estudio muestran la utilidad de los SSR para profundizar en el conocimiento y asignacion de grupos heteroticos y revelar la relacion de parentesco. Asi mismo, aporta evidencia adicional a favor que la caracterizacion molecular permite la estimacion de la variabilidad genetica, la cual, combinada con caracteres fenotipicos de interes, puede convertirse en una herramienta util que apoye el mejoramiento genetico convencional.