Se evaluo el efecto de la atrazina en la dinamica de las poblaciones de microorganismos de un suelo de Saldana, Tolima. Los grupos de microorganismos estudiados fueron: algas, hongos en general, hongos formadores de Micorriza Arbuscular (MA), actinomicetos, bacterias en general, bacterias solubilizadoras de fosforo, bacterias desnitrificantes, bacterias amonificantes, nitrobacter y nitrosomonas (el conjunto de los anteriores organismos fue analizado y catalogado como poblacion microbial total). Se utilizo un diseno completamente al azar con cinco tratamientos y cuatro repeticiones. Los resultados indicaron especificamente que el herbicida atrazina causa efecto detrimental a traves del tiempo sobre poblaciones de bacterias amonificantes, bacterias nitrosomonas, bacterias desnitrificantes, bacterias nitrobacter y algas. Sin embargo, el sustrato (bagazo de maiz) al ser adicionado con atrazina atenuo el efecto causado par el herbicida, aumentando el numero de unidades formadoras de colonia por gramo de suelo (U.F.C./g de suelo). No obstante el mencionado incremento fue menor al suelo no tratado (tratamiento T1 ) o suelo original exceptuando la poblacion de bacterias amonificantes y desnitrificantes las cuales si superaron este tratamiento. De la misma manera, en el suelo cercano a la rizosfera se presento igual efecto de aumento de U.F.C. /g de suelo al adicionar sustrato con atrazina, a excepcion de la poblacion de algas. De igual forma, el incremento fue menor al del tratamiento de suelo no tratado (T1 ). Se obtuvo ademas que el sustrato, al ser adicionado, solo aumento en mayor numero las U.F.C./g de suelo que al adicionarlo con la atrazina; excepto la poblacion de bacterias amonificantes y desnitrificantes, las cuales reportaron valores de U.F.C./g de suelo inferiores a las obtenidas al aplicar sustrato con atrazina.