El proposito de esta investigacion fue evaluar a escala de laboratorio la accion de microorganismos acidofilos nativos compatibles con las especies Acidithiobacillus ferrooxidans y thiooxidans, aislados de la mina El Zancudo, Titiribi (Antioquia) sobre la oxidacion de sulfuros donde predominan la pirita y arsenopirita, variando las concentraciones de sustrato (8% y 16%), y el tamano de particula (75 um y 106 )xm). Los resultados de las mediciones diarias de pH y potencial redox realizadas por un tiempo de 25 dias, demuestran que hubo una actividad de oxidacion eficiente y se llego a valores de pH de 1,4 y potencial redox de 600 mV, ademas de encontrarse en solucion niveles altos de alrededor de 20 g/L de As y 60 g/L de Fe. Por los analisis de DRX, FTIR y SEM/EDX, se evidencia la presencia de productos propios de la oxidacion bacteriana, como jarosita y arsenatos de hierro, ademas de una corrosion inicial y avanzada en los granos de pirita y arsenopirita, respectivamente. Palabras clave: quimiolitotrofos, biolixiviacion, pirita, arsenopirita, mineralogia aplicada.