Desde el descubrimiento del codigo genetico se han llevado a cabo varios estudios sobre el tRNA, debido a su gran importancia en la sintesis de proteinas. En este sentido, se realiza el presente estudio sobre la estructura primaria de la molecula y su relacion con la teoria de coevolucion del codigo genetico, propuesta por Wong (1975). Se construyo una base de datos especifica para tRNAs aminoacido especificos , con 10.504 secuencias unicas. Las secuencias se obtuvieron del Genebank y de Mathias Sprinzl y se organizaron en grupos, como sigue: archaebacteria, eubacteria, unicelulares, animales, plantas y cloroplasto. Las secuencias se alinearon usando Clustal y se obtuvieron los consenso con Genedoc, respetando siempre los grupos establecidos. Se empleo una metodologia alternativa, en la cual se exploraron homologias desde 100% hasta 60%, en intervalos de 5%. Las secuencias consenso se agruparon mediante el algoritmo Neighbour-joining de Clustal X. Se encontro que las secuencias consenso tienen en promedio 47.30 bases, esto representa el 63.90% de la longitud promedio (74 bases) de las secuencias de tRNAs. Las secuencias consenso son ricas en bases con 100% de homologia, lo cual representa cerca del 60.80% de la longitud total del consenso . Mas aun, los consensos mostraron mayor proporcion de bases CG en general. Los siguientes grupos son los mas representativos: 1. (ala,cys) se encontro en eubacteria, unicelulares, animales y cloroplastos. 2. (ile,ala) se encontro en archaebacteria, eubacteria, unicelulares, plantas y cloroplastos. 3. (ile,asn) en archaeacteria, unicelulares, animales, plantas y cloroplastos. 4. (ala,asn) en archaebacteria, unicelulares, plantas y cloroplastos. Estos resultados muestran el alto grado de conservacion de la estructura primaria de la molecula de tRNA y sugieren la existencia de huellas sobre el origen del codigo genetico.
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RNA and protein synthesis mechanisms
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FuenteDOAJ (DOAJ: Directory of Open Access Journals)