En este articulo se presenta un diagnostico de la gestion de la higiene basado en el cumplimiento de los prerrequisitos de un sistema HACCP, en 53 empresas del sector agroalimentario que operan en el departamento del Huila en Colombia. La metodologia de evaluacion correspondio a la verificacion del cumplimiento de las listas de chequeo de dos instrumentos: GHYCAL (Gestion de la Higiene y Calidad) y SQ 12 empresas en nivel de cumplimiento basico, al obtener valoraciones entre el 75 % y el 95 %, y 7 empresas con nivel de cumplimiento superior, por resultar con evaluaciones superiores al 95 %; adicionalmente se valoraron similitudes y diferencias entre empresas y entre sectores estudiados, haciendo uso de tecnicas de estadistica multivariada.