La expansion e intensificacion del uso de la frontera agricola han determinado crecientes procesos de deforestacion, asi como el aumento de la fertilizacion, las cuales deterioran la calidad de agua en cuencas de areas rurales. En Colombia esta problematica es especialmente marcada en la region andina. Este estudio aplica un modelo de simulacion hidrologica para comparar el efecto de cuatro escenarios de manejo espacial de la cobertura sobre la migracion de nutrientes provenientes de practicas agricolas en la cuenca alta del rio Magdalena. La simulacion del movimiento del agua por laderas y canales realizada mostro un aceptable desempeno (S/ σΔ=0,84; R=0,82; R2=0,67); sin embargo, la dinamica de migracion de contaminantes fue insensible a los cambios en la cobertura vegetal realizados en las configuraciones de las distintas simulaciones (p≥0,05), pues se encontraron reducciones en las cargas de contaminantes, en el punto de cierre del area de estudio, que oscilaban tan solo entre 2% y 4%. Las reducciones presentadas se explican en razon de las propiedades intrinsecas de la vegetacion, como barrera ante el flujo de sedimentos, su capacidad de aumentar los procesos de infiltracion en el suelo y, por ende, disminuir los procesos de escorrentia y la absorcion de nutrientes por parte de las plantas.