La variacion de la composicion , abundancia y diversidad del zooplancton fue analizada durante la fase de llenado del embalse Amani en un gradiente horizontal y vertical, a partir de trece muestreos semanales realizados entre junio y agosto de 2002. La composicion del zooplancton es similar a otros ecosistemas lenticos tropicales de baja altitud y fue registrado un total 32 taxa, de los cuales se destaca el rotifero Keratella por su elevada abundancia durante junio y julio. Rotifera fue el grupo que presento la mayor riqueza de especies (16) asi como una sobresaliente dominancia numerica sobre copepodos y cladoceros, con una abundancia relativa superior al 60%. La densidades promedio del zooplancton fluctuaron de manera significativa (6 a 1525 org l-1), y de forma diferencial entre los brazos del embalse y los sectores de confluencia y presa, que presentaron los menores intervalos (14-208 org l-1 y 6-108 org l-1, respectivamente). En el presente trabajo se incluyen los patrones de comportamiento de la abundancia de los generos mas frecuentes de zooplancton asi como de aspectos relacionados con la dinamica poblacional de los copepodos Thermocyclops decipiens y Mesocyclops aspericornis. Se discuten los cambios en la estructura de la comunidad del zooplancton y se mencionan las posibles interacciones y fenomenos de regulacion entre los diferentes taxa zooplanctonicos y de estos con el fitoplancton. Finalmente se presenta un catalogo de microfotografias de los organismos registrados. Este trabajo constituye un aporte importante de ecologia descriptiva del zooplancton limnetico y da pautas para posteriores monitoreos en este embalse.