Introduccion: dentro de la familia se conjugan una serie de acontecimientos que permiten el desarrollo de sus integrantes. Es de suponer que si los ninos crecen en un entorno favorable socioeconomico y afectivo, podrian llegar a tener un buen estado nutricional. Si se relacionan la seguridad alimentaria y la funcionalidad familiar con el estado nutricional, ello da cuenta de factores alternativos que pueden intervenirse para prevenir la desnutricion en los ninos. Metodos: fueron seleccionados probabilisticamente en 63 municipios los usuarios de complementacion alimentaria del Plan de Mejoramiento Alimentario y Nutricional (MANA). La muestra fue de 11 436 ninos, y el muestreo utilizado fue aleatorio simple. A cada usuario se le realizo evaluacion antropometrica, teniendo en cuenta las tablas de referencia de la OMS 2006 y la Resolucion 2121 de Ministerio de la Proteccion Social. Se les aplico a sus familias la escala de seguridad alimentaria en el hogar y se evaluo la funcionalidad familiar con el instrumento de Apgar familiar. Se utilizo estadistica no parametrica, regresion logistica y analisis de correspondencias multiples para analizar la informacion. Resultados: el retraso en la estatura se encontro en 14,9 % de los menores, 3,3 % presento muy bajo peso para la edad, 1,2 % muy bajo peso para la estatura y delgadez en 2 %. Se evidencio, por el contrario, elevada frecuencia de sobrepeso y obesidad (superior al 30 %). En mas del 70 % de los hogares se percibio inseguridad alimentaria y disfuncionalidad familiar en el 49 %. Se asociaron positivamente con la desnutricion cronica, el numero de integrantes del hogar, la inseguridad alimentaria, la disfuncion familiar y la desnutricion aguda. Conclusion: se encontro asociacion entre la seguridad alimentaria, la funcionalidad familiar y la desnutricion cronica, por lo cual estos, al igual que otros, se convierten en factores de riesgo y hacen parte de indicadores indirectos