El ocelote (Leopardus pardalis) es uno de los felinos con mayor distribucion geografica a lo largo del continente americano. Se han designado 11 subespecies, soportadas en caracteristicas morfologicas. Sin embargo, estas subdivisiones no han sido aclaradas molecularmente. En este trabajo se analizaron siete subespecies, L. p. mearnsi, L. p. pseudopardalis, L. p. maripensis, L. p. pusaeus, L. p. aequatorialis, L. p. steinbachi, y L. p. mitis a nivel craneometrico, para reconocer y verificar la diferenciacion entre subespecies de ocelote; y a nivel molecular, mediante el uso de marcadores heterologos para comprobar la existencia de estas subespecies e igualmente conocer detalles de su estructura poblacional e historia evolutiva. Unicamente para el analisis craneometrico fueron incluidas dos subespecies norteamericanas L. p. pardalis, y L. p. albescens; y para comparar el nivel molecular se emplearon los datos de Walker (1997). Pudieron ser ratificadas solo cuatro subespecies, de las cuales, L. p. pardalis, L. p. albescens y L. p. steinbachi fueron las mas diferenciadas para ambos niveles. Las demas subespecies, presentaron altos niveles de flujo genico que indican una homogenizacion de la especie. No obstante, se evidencio un exceso de homocigotos posiblemente causado por alelos nulos o endogamia. Al combinar los resultados de cada estudio, se puede clarificar entonces cuestiones taxonomicas y sugerir manejos de conservacion para la especie, ya sea como una unidad integral o como varias unidades particulares.