A partir de la emergencia nacional ocasionada por las fuertes inundaciones causadas entre 2009 y 2011 en la mayoria del territorio nacional, se identifico una profunda vulnerabilidad institucional en el nivel local y regional de toma de decisiones. En este marco, la presente investigacion busca establecer una herramienta metodologica que permita optimizar la gestion del riesgo en municipios costeros y mejorar su gobernabilidad. Para ello, se conformo un equipo de trabajo con investigadores de cinco instituciones, quienes utilizaron revisiones documentales, visitas de campo, matrices de analisis y talleres grupales como metodologia. El area de estudio seleccionada fue Riohacha (La Guajira, Colombia), como ciudad costera piloto, y Santiago de Cuba como ciudad costera de referencia. Como resultado, se disenaron cuatro indicadores que permiten medir la gobernabilidad asociada al riesgo costero: coordinacion y cooperacion institucional, conocimiento del riesgo, medidas de reduccion del riesgo y capacidad de respuesta institucional a emergencias. Estos cuatro indicadores permitiran disenar una herramienta informatica para fortalecer las instituciones locales responsables de la gestion del riesgo en los municipios costeros de Colombia.