La tecnica de Amplificacion Arbitraria de Fragmentos Polimorficos de ADN (RAPD) fue utilizada para identificar marcadores geneticos utiles para el desarrollo de un metodo diagnostico para Fusarium oxysporum f.sp. dianthi , el agente etiologico de la enfermedad del marchitamiento del clavel. Con el fin de identificar fragmentos geneticos caracteristicos de este patogeno, un total de 18 aislados diferentes, provenientes de diferentes lugares del mundo y 17 cepas de F. oxysporum de otras formas especiales fueron amplificadas utilizando 15 iniciadores diferentes. Aunque ninguno de los iniciadores empleados en este estudio amplifico una banda comun a todas las formas especiales dianthi , el iniciador OPA 17 mostro un patron de RAPD que permitio la identificacion de cuatro grupos polimorficos dentro de este grupo taxonomico. Este mismo iniciador, permitio la discriminacion entre aislados de Fusarium oxysporum f.sp. dianthi y cepas de F. oxysporum de otras formas especiales. No se observo una correlacion directa entre el patron de RAPD y las razas reportadas para F. oxysporum f.sp. dianthi , previamente determinadas mediante ensayos biologicos por otros grupos de investigadores. Los analisis de hibridacion molecular con fragmentos escogidos de estos patrones de RAPD, permitieron el reconocimiento selectivo de los cuatro grupos descritos. Los fragmentos genomicos identificados, son candidatos para el desarrollo de un sistema diagnostico por PCR para este patogeno del clavel.