Los combustibles obtenidos a partir de materia vegetal, como el etanol y el biodiesel, estan tomando importancia en la dinamica energetica mundial, gracias principalmente a que son mas economicos y menos contaminantes del medio ambiente que los combustibles fosiles. El mercado de biocombustibles ha producido un incremento en las areas de cultivo tanto de plantas regularmente usadas como materia prima para su obtencion como de aquellas con potencial de ser nuevas fuentes de produccion, al igual que ha impulsado la investigacion basica orientada hacia el incremento en calidad y produccion de diferentes cultivos. Las plantas que almacenan cantidades importantes de almidon, azucares simples o aceites son el blanco principal para la produccion de biocombustibles, aunque nuevas tecnologias estan permitiendo la utilizacion de celulosa como materia prima. El cultivo de yuca (Manihot esculenta) esta ampliamente distribuido en toda la zona tropical y es la base alimenticia de cerca del 10% de la poblacion mundial. El alto contenido de almidon en las raices almacenadoras de la yuca hace de este cultivo una opcion para la obtencion de etanol. El uso de tecnicas de mejoramiento no convencional de variedades de yuca permitira la generacion de plantas mas aptas para la industria de biocombustibles. En este articulo de reflexion se revisa el estado actual de los biocombustibles a nivel mundial y nacional, y se comentan los beneficios y retos a afrontar en cuanto a las implicaciones respecto al medio ambiente y la alimentacion humana. Finalmente se discute el potencial de la yuca como fuente eficiente de materia prima para la obtencion de biocombustibles en Colombia.