Introduccion: Colombia es el segundo pais con mayor biodiversidad del mundo, posee 10 % del recurso vegetal mundial representado en 50 000 especies vegetales, de las cuales la costa norte colombiana posee cerca de 3 400. Esta region se caracteriza por mantener una rica tradicion de uso de este recurso natural para tratar sus problemas de salud. Objetivo: realizar el estudio quimico sobre 45 extractos etanolicos de 39 especies vegetales, que son utilizadas en la medicina tradicional de la costa atlantica colombiana, con el proposito de contribuir al conocimiento con base cientifica, de los metabolitos secundarios presentes en estas plantas. Metodos: se recolectaron cada uno de los organos de las especies; la droga fresca fue sometida a extracciones sucesivas con etanol 98 % y en los extractos se identificaron los diferentes grupos de metabolitos secundarios presentes. Resultados: en los diferentes extractos etanolicos se detecto una alta diversidad de metabolitos secundarios, con predominio de los flavonoides, derivados antracenicos, triterpenos, compuestos cardiotonicos y alcaloides. Por primera vez se reportaron estudios quimicos para las especies Sarcostemma clausum (Jacq) Schult., Diospyros inconstans Jacq., Sterculia apetala (Jacq.) H. Karst., Ceratopteris pteridoides Hooker., Cecropia peltata L., Cordia dentata Poir. y Gustavia superba (Kunth) O. Berg. Conclusiones: se evidencio presencia de flavonoides como fitoconstituyentes mas abundantes en las especies seleccionadas. Los resultados constituyen un apoyo para continuar con los estudios quimicos y farmacologicos de estas especies.