Se realizo un estudio tridimensional cuantitativo de relacion-estructura (3D-QSAR) con 40 moleculas tipo benzimidazol e imidazolina derivadas de (s) isotiazolidinonas y su union con el sitio activo de la proteina tirosina fosfatasa 1B (PTP 1B), utilizando el programa GOLD 3.0. La superposicion molecular de los ligandos en la plantilla fue llevada a cabo por el metodo Database Alignment. El mejor modelo fue el constituido por la combinacion de los campos estericos y electrostaticos de CoMFA, los cuales arrojaron los siguientes parametros: q 2 = 0,659 y r 2 = 0,997. Usando el modulo LeapFrog de SYBYL fue posible generar mas de 10.000 moleculas nuevas, de las cuales 46 mostraron, teoricamente, un mejor valor de la actividad biologica que su precursora. Los datos obtenidos en el presente estudio podrian impulsar el diseno de nuevos y mas potentes inhibidores de la PTP 1B, como agentes para el tratamiento de la diabetes.