Se estudio la distribucion espacial de la macroinfauna asociada a pastos marinos de las bahias Hooker, Honda y Sea Horse de la isla de San Andres (Caribe colombiano), en epoca seca. Se tomaron muestras de sutrato en tres rangos de profundidad (0-2, 2-5 y >5m) en cada bahia para un total de nueve estaciones. Se compararon las caracteristicas estructurales de cada estacion, encontrando bajas densidades promedio (187 ind/m2). Por medio de analisis de clasificacion y la tecnica de ordenacion NMDS, a partir de las abundancias a nivel de familia, se definieron cuatro grupos. La distribucion espacial de estos grupos indica que forman parte de una misma comunidad con amplia variacion espacial en su composicion y estructura. Los efectos generados por la corriente superficial y por la heterogeneidad estructural del habitat son propuestos como posibles causas de la variacion de la comunidad.