Las esponjas Aplysina insularis (con epitelio libre de epibiontes), y Aplysina lacunosa (con epitelio recubierto por epibiontes) fueron escogidas como modelo para estudiar algunos de los mecanismos quimicos y bacterianos que podrian determinar su grado de epibiosis. A traves de la tecnica molecular de electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE), se determino que la comunidad de epibiontes bacterianos varia entre individuos, pero en general es muy similar entre especies de esponja, sin ninguna relacion con el grado de epibiosis. Para las dos especies, se detectaron diferencias en la presencia/ausencia de compuestos bromados bioactivos en las fracciones quimicas del extracto crudo. Todas las fracciones quimicas con compuestos bromados inhibieron el crecimiento de todas las cepas bacterianas aisladas de biopeliculas asociadas a diferentes superficies (pinacodermo externo de A. insularis y A. lacunosa, pinacodermo del pseudoatrio de A. lacunosa, y una superficie inerte, la concha del bivalvo Donax sp.). Tres fracciones quimicas de A. lacunosa y dos de A. insularis presentaron los niveles de actividad antibacteriana mas altos. La susceptibilidad in vitro a las fracciones con compuestos bromados de las bacterias aisladas de las superficies limpias fue menor que aquellas aisladas de superficies con mayor grado de epibiosis. Asumiendo que los compuestos bromados son exudados, ellos podrian controlar el crecimiento de algunas poblaciones bacterianas in situ. Se sugiere que las sinuosidades morfologicas de la superficie de A. lacunosa restringen la exudacion de compuestos bromados hacia las depresiones inhalantes, las cuales se mantienen limpias, mientras que esto permite que las crestas sean colonizadas, quiza para camuflarse. Las cepas bacterianas aisladas del pinacodermo externo y limpio de A. insularis presentaron una frecuencia alta de interacciones antagonicas in vitro con bacterias aisladas de la misma superficie, sugiriendo que las interacciones antagonicas pueden prevenir la epibiosis a traves de la regulacion del crecimiento bacteriano. Se discuten varios mecanismos por los cuales la epibiosis puede ser controlada.