Desde hace 30 anos la Universidad Nacional de Colombia ha sido la institucion en Colombia encargada del cuidado de individuos de Crocodylus intermedius en cautiverio, especie declarada en peligro critico de extincion en el mundo por la UICN en 1984 y en el territorio nacional por el Ministerio del Medio Ambiente en 1997 con la resolucion 676 del 21 de julio. Actualmente a cargo del Centro Estacion de Biologia Tropical “Roberto Franco” (CEBTRF) en Villavicencio, de la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogota, existen 113 individuos del cocodrilo del Orinoco de los cuales mas del 50% son producto de eventos reproductivos ex situ, 43 individuos estan en traslado temporal en varios centros de cria, dos de ellos zoologicos, uno fuera del area de distribucion natural de la especie. Esta evaluacion permitio conocer que no se tienen lineamientos para el manejo de los animales tales como diligenciamiento de bases de datos, hojas de vida, control de dietas y posturas, seguimiento a crias, reproduccion, condiciones sanitarias, aspectos clinico y veterinario, infraestructura disponible, entre otros. El presente trabajo sugiere algunas pautas para el manejo de la especie en cautiverio y que junto con el sistema de identificacion electronica que posee el CEBTRF cuya base de datos reunira aspectos biologicos, clinicos, veterinarios y de manejo de cada uno de los animales, aspira a brindar una guia en el proceso que permitira cumplir con el objetivo de conservacion de la poblacion.