El decreto 309 del 2000 y la resolucion 68 de 2002 establece en Colombia el procedimiento para la presentacion de la solicitud, tramite y obtencion del permiso de estudio con fines investigacion cientifica en diversidad biologica (PEFIC). La Unidad Administrativa Especial de Parques Nacionales Naturales (UAESPNN), es autoridad competente para el 9% de las areas protegidas en Colombia. Para evaluar la coherencia de la normatividad se examina si los requisitos y obligaciones contemplados en las dos normas se cumplen en los permisos tramitados por la UAESPNN y se caracterizan los procedimientos aplicados en los tramites de PEFIC realizados en la entidad. Igualmente se establecen tendencias y caracteristicas generales de la investigacion biologica que se desarrolla en las areas protegidas de la UAESPNN. Se accedio a los expedientes correspon-dientes a PEFIC tramitados en los anos 2004, 2005 y 2006 de la UAESPNN y se recopilo informacion del formato No. 1 del Sistema Nacional Ambiental (SINA). Se encontro que los requisitos que establece la normatividad son parcialmente cumplidos por los investigadores y las obligaciones a las que se compromete el investigador no se cumplen, ni se monitorean por la entidad. Ademas la duracion del tramite es mayor que el establecido por la norma. Finalmente no se pudo establecer una relacion de la investigacion que se reali-za en la UAESPNN por los investigadores que acceden al PEFIC con las necesidades de manejo y conserva-cion de las areas protegidas. Se incluyen recomendaciones para mejorar los procedimientos en la UAESPNN.