Entre febrero y mayo de 2006, se realizaron tres muestreos para establecer la estructura de las praderas de Thalassia testudinum en la Bahia de Sapzurro. Se midieron algunas variables fisico quimicas y se instalaron 18 sitios de muestreo, nueve en la franja interna y nueve en la externa; en cada sitio se ubico un cuadrante de 20 x 50 cm para determinar la cobertura y se colectaron las hojas de T. testudinum. La salinidad superficial vario entre 31.65 y 9.73 UPS; fue el unico factor que limito el desarrollo optimo de las praderas. Los parches de T. testudinum se distribuyeron entre 0.8 y 2.7 m de profundidad. La biomasa en peso seco presento valores bajos en comparacion con otras areas del Caribe Colombiano, debido posiblemente a la variacion de la salinidad en la Bahia. Los analisis estadisticos mostraron diferencias significativas entre la longitud de las hojas en las franjas (P = 0.0223899) y entre franjas en el muestreo de baja salinidad (P = 0.0379739).