Introduccion: Los desordenes musculo esqueleticos (DME) afectan la calidad de vida, dado al impacto global en la condicion fisica, el bienestar psicologico y funcional. Estas entidades generan un gran numero de indemnizaciones y en algunas oportunidades invalidez. Objetivo: Explorar la asociacion del grado de perdida de la capacidad laboral con la comorbilidad de los desordenes musculo esqueleticos y otros factores asociados. Materiales y metodos: Estudio de corte transversal basado en registros e historias clinicas. Del total (n=1427) 513 casos presentaban diagnostico de DME y 240 solicitaron la perdida de capacidad laboral a la Junta de Invalidez en Huila entre 2009 y 2012. Resultados:Hubo incapacidad permanente parcial en 73,3% e invalidez en 26,7%. Se encontro una asociacion con respecto a la edad (p=0,002), donde el rango de 50-65 anos presento mayor perdida de capacidad laboral; con el sexo (p=0,047), siendo el femenino mas prevalente la invalidez (34,7%) que en el masculino (23,2%) y la comorbilidad (p=0,019), donde los desordenes musculo esqueleticos y los trastornos depresivos generaron mayor perdida de capacidad laboral. No se encontro asociacion signifcativa con la escolaridad, ofcio y actividad economica. En el analisis multiple se encontro asociacion con el origen no ocupacional (OR=4.03, IC 95%: 2.01-8.07), ser mujer (OR=2.57, IC 95%: 1.14-5.77), y nivel de escolaridad tecnico (OR=12.21, IC 95%: 1.37-108.63). Conclusiones: La comorbilidad, edad avanzada, sexo femenino, origen no ocupacional y menor educacion se asociaron con mayor perdida de capacidad laboral. Palabras Clave :discapacidad, desordenes musculo esqueleticos, comorbilidad. Forma de citar: Perdomo-Hernandez M. Grado de perdida de capacidad laboral asociada a la comorbilidad de los desordenes musculo esqueleticos en la Junta de Califcacion de Invalidez, Huila, 2009-2012. rev.univ.ind.santander.salud 2014; 46 (3): 249-258. ABSTRACT Introduction: Musculoskeletal disorders (MED) impact quality of life, physical condition, psychological and functional well-being. These entities generate a large number of allowances and handicaps. Objective: To explore the association of loss of working capacity with musculoskeletal disorders and other associated factors. Materials and methods: Cross-sectional study based on registries and medical records. From the total (n=1427 cases), 513 had been diagnosed with MED and 240 of this requested a working capacity loss declaration to the Disability Rating Board in Huila between 2009 and 2012. Results: There were permanent partial disability in 73.3% and disability in 26.7%. An association with age (p=0.002) showed that population between 50 and 65 years old had higher loss of workning capacity. Besides, association with sex (p=0.047) identify that females had more disability prevalence (34.7%) than males (23.2%) and that comorbidity (p=0.019) with musculoskeletal disorders and depressive disorders generated greater loss of working capacity. It wasn’t found a signifcant association with education, occupation or economic activity. During multivariated analysis, it was found a signifcant association with non-occupational origin (OR=4.03, 95% CI: 2.01-8.07), female (OR = 2.57, 95% CI: 1.14-5.77), and the level of technical education (OR = 12.21, 95% CI: 1.37-108,63). Conclusions: Comorbidity, older age, female, non-occupational origin and the less education were associated with greater loss of working capacity.