OBJETIVO : determinar las caracteristicas epidemiologicas, clinicas y microbiologicas, y la mortalidad por sepsis comprobada en la unidad de neonatos del Hospital Universitario San Vicente de Paul (HUSVP) de Medellin, Colombia, entre enero de 2003 y diciembre de 2005. METODOS : este es un estudio de cohorte retrospectiva descriptiva. Se revisaron las historias clinicas de los neonatos con sepsis comprobada. RESULTADOS : durante el periodo analizado ingresaron a la unidad neonatal 2447 neonatos de los cuales 181 presentaron sepsis comprobada (7,43%), de estos en 10 casos (5,4%) no fue posible encontrar la historia clinica. En total se analizaron 171 historias donde se reportaron 185 episodios de sepsis. El germen mas frecuentemente aislado fue Staphylococcus spp., coagulasa negativa (40,2%), seguido de los bacilos gram negativos (33,6%). Se hallo Candida spp., en 5,5% de los casos. Las manifestaciones mas comunes fueron apnea e intolerancia a la via oral. Se encontro una mortalidad del 6,4%; los bacilos gram negativos representaron el 50% de los germenes asociados con muerte; la leucopenia, la trombocitopenia y la hipotension se asociaron con mortalidad. Las alteraciones del hemograma, clasicamente consideradas sugestivas de sepsis neonatal, como bandas por encima del 10%, indice de neutrofilos I/T mayor de 0,2 y leucocitosis mayor de 30.000 µ L se presentaron con poca frecuencia en nuestra cohorte. CONCLUSIONES: hay un cambio en la epidemiologia de la sepsis neonatal debido a la supervivencia de neonatos de menor peso y a la estancia prolongada en las UCIN; el laboratorio tiene poco valor diagnostico.