En un banco de dientes los protocolos son indispensables para garantizar: la correcta organizacion y el buen funcionamiento, la reproduccion y estandarizacion que disminuyan la contaminacion cruzada, conserven las caracteristicas y propiedades sicoquimicas originales de los dientes, el cumplimiento de la normatividad etico–legal y un correcto manejo de los desechos. Objetivo: proponer los protocolos de desinfeccion, almacenamiento y transporte para el Biobanco de dientes en la Universidad Nacional de Colombia. Materiales y metodos: se revisaron las bases de datos Pubmed, Science Direct y Scielo utilizando las palabras “teeth, human, tooth bank, disinfection, sterilization, storage, organization, biosecurity, biobank, protocol, prevention”. Fueron incluidos 37 articulos, publicados entre 1988 y 2014, sobre banco de dientes, lineamientos para su limpieza, desinfeccion y almacenamiento. Se consultaron las normas internacionales y las etico–legales vigentes en Colombia para donacion, manejo e investigacion con organos. Se estudiaron, analizaron y modicaron criticamente los procesos desde la recepcion hasta su transformacion de organos en muestras aptas para investigacion teniendo en cuenta la literatura, las experiencias previas en el laboratorio a traves de trabajos de grado y tesis de posgrado, y los conocimientos en quimica inorganica. Resultados: se planearon y elaboraron los protocolos de recoleccion, transporte, limpieza/desinfeccion y almacenamiento. Conclusion: basados en la literatura cientica, en normas internacionales y nacionales vigentes y la experiencia en el laboratorio se propusieron los protocolos de desinfeccion, transporte particulares para el Biobanco de dientes de la Universidad Nacional de Colombia.