Streptococcus pneumoniae serotipo 5 es una causa importante de enfermedad invasiva en Colombia. Estudios preliminares han demostrado la circulacion de un clon reconocido por la red de epidemiologia molecular de neumococo (PMEN) como clon 19-Colombia5, susceptible a penicilina pero asociado con resistencia a tetraciclina y cloranfenicol. Con el objetivo de establecer las relaciones geneticas de aislamientos invasores de S. pneumoniae serotipo 5 recuperados en Colombia entre 1994 y 2004, con el clon 19-Colombia5, se estudiaron 83 aislamientos, que tenian datos de susceptibilidad a penicilina, vancomicina, ceftriaxona, eritromicina, trimetoprim sulfametoxazol, cloranfenicol y tetraciclina, de los cuales, 29 fueron recuperados de ninos menores de cinco anos. Se les determino el patron de restriccion por electroforesis de campo pulsado (PFGE), usando la enzima Sma I. La similitud genetica entre los aislamientos y el clon se establecio segun los criterios de Tenover utilizando el programa Fingerprinting‰ II para la generacion de dendrogramas. Todos los aislamientos se agruparon en el patron electroforetico A, del cual se derivaron 18 subtipos, todos relacionados con el clon 19-Colombia5. El patron A se establecio en 32 aislamientos (38,6%), el subtipo A8 en 18 (21,7%) y el A5 en 10 (12%), los patrones restantes agruparon los otros 23 aislamientos. Los 34 aislamientos resistentes a tetraciclina y cloranfenicol, estuvieron relacionados con el patron electroforetico A (n=32) y los subtipos A16 (n=1) y A28 (n=1), caracterizados por presentar una banda de 340 Kb, al igual que el clon. Estos resultados muestran la prevalencia y circulacion continua de aislamientos de S. pneumoniae serotipo 5, los cuales estan geneticamente relacionados con el clon 19-Colombia.