Durante la epoca seca del ano 2005 en los humedales Guaymaral, Santamaria del Lago y Tibanica (escala regional), ubicados dentro del perimetro urbano de Bogota, Colombia; se seleccionaron cinco estaciones en cada uno (escala sectorial) y en cada estacion se colectaron tres replicas (escala local). Se estudio la composicion y abundancia de las diatomeas del perifiton en raices de macrofitas, para evaluar su potencial como bioindicadoras en relacion a las condiciones troficas de los humedales. La composicion cuantitativa y cualitativa de diatomeas de la comunidad del perifiton difiere en los tres humedales; el numero de generos de diatomeas en Santamaria del Lago, Guaymaral y Tibanica, se registra en forma descendente, al contrario de la abundancia de diatomeas; lo cual esta relacionado con el estado trofico de cada humedal, ya que Santamaria del Lago es el humedal con menor estado de trofismo, Guaymaral estado intermedio y Tibanica el de mayor estado de eutroficacion (segun indices de Carlson) lo que muestra a las diatomeas como bioindicadoras de la sobrecarga de nutrientes en los humedales. Se evidencio una relacion lineal inversa, para nitrogeno total y fosforo total con la riqueza de taxones de diatomeas; lo que permite proponer a las diatomeas como bioindicadoras de la tension producida por el desequilibrio de estos biogeoelementos asociado con el estado de eutrofia extrema o hipereutrofia en los humedales estudiados.