INTRODUCCION: Colombia es un pais al norte de Suramerica y debido a esta posicion privilegiada fue la entrada para la colonizacion espanola desde el siglo XVI al continente. A la llegada de los espanoles, habitaban en el territorio de la actual Colombia varias tribus, que al igual que en meso y Suramerica fueron diezmados por las guerras y por las enfermedades europeas. En la actualidad quedan los descendientes de estos indigenas que sobrevivieron distribuidos por todo el pais y han transmitido sus costumbres lenguajes y genes. OBJETIVOS: determinar la relacion de algunas de las tribus actuales del territorio nacional con base en los genes HLA-DRB1 y DQB1 y ademas, establecer su relacion con las lenguas nativas. MATERIALES Y METODOS: se compararon los resultados de 882 cromosomas de 11 poblaciones amerindias colombianas. Para la comparacion se calcularon las distancias geneticas con dendograma Neigbour Joining y diagramas de correspondencia. RESULTADOS: con base en estos analisis se encontro que existe una relacion cercana entre los indigenas de la Sierra Nevada de Santa Marta tanto genetica como linguisticamente. Tambien existe una relacion cercana entre los indigenas del pacifico, compartiendo tronco linguistico. Dos poblaciones se mostraron aislados del patron linguistico y genetico anteriores: los Wayuu y los Coreguaje. DISCUSION: en este estudio se aprecian tres tendencias poblacionales y linguisticas. Los indigenas de la Sierra Nevada de Santa Marta comparten raices linguisticas entre si, ya que su tronco principal es el Chibcha. Las del Pacifico, poseen mas relacion geografica que linguistica, pero tienen una asociacion genetica entre si. Lo anterior puede llevar a concluir que en estos dos grupos pudo haber una mezcla entre ellos. Por otro lado, se presentan dos poblaciones aisladas de los dos troncos anteriores, tanto en lenguaje como geneticamente, los Wayuu y Coreguaje. CONCLUSIONES: las tribus amerindias de la Sierra Nevada de Santa Marta y del occidente colombiano poseen relacion genetica y linguistica. Tambien, se observo una influencia de lenguajes suramericanos en los indigenas de la Orinoquia, lenguajes centroamericanos y caribenos en los del Pacifico y una influencia Chibcha en los de la Sierra Nevada de Santa Marta.