RESUMEN La hibridacion in situ fluorescente (FISH), es una tecnica que emplea sondas de oligonucleotidosmarcadas con fluorocromos las cuales van dirigidas hacia secuencias especificas del acido ribonucleicoribosomal (ARNr), lo que permite la identificacion rapida y especifica de celulas microbianas ya sea queesten como celulas individuales o se encuentren agrupadas en su ambiente natural. El conocimiento dela composicion y distribucion de los microorganismos en los habitats naturales, proporciona un soportesolido para comprender la interaccion entre las diversas especies que componen el micro habitat. Elobjetivo de la revision es presentar la forma como ha evolucionado la hibridacion, el empleo del ARNrcomo molecula diana, los tipos de marcaje, los marcadores fluorescentes empleados hoy en dia, lametodologia, asi como las mejoras que se le han hecho a la tecnica FISH al emplearse en conjunto conotras tecnicas en la identificacion microbiana. Salud UIS 2011; 43 (3): 307-316 Palabras claves: FISH, sonda de oligonucleotidos, ARNr, diagnostico microbiano,fluorocromo, hibridacion ABSTRACT Fluorescence in situ hybridization (FISH), is a technique that uses oligonucleotides probes labeled with fluorochromeswhich are directed to specific sequences of ribosomal ribonucleic acid (rRNA), this allows the rapid and specificidentification of microbial cells whether as individual cells or grouped cells in their natural environment. Knowledgeof the composition and distribution of microorganisms in natural habitats provides a solid support to understandinteraction between different species in the microhabitat. This review shows how hybridization has evolved, the useof rRNA as target molecule, the type of labeling, the labeled uses today in fluorescent and the methodology, as wellas the improvements that have been made to the FISH technique when is used in conjunction with other techniquesin microbial identification. Salud UIS 2011; 43 (3): 307-316 Keywords: FISH, oligonucleotides, probes, rRNA, microbial diagnostic, fluorochromes, hybridization