La malaria es una enfermedad prevenible que persiste como uno de los mayores problemas de salud publica en Colombia. Una asignacion eficaz de los recursos para su control requiere la identificacion de zonas endemicas y una caracterizacion sistematica de estas en varios aspectos de manera simultanea. Se utilizo aqui la tecnologia de Sistemas de Informacion Geografica (SIG) para integrar datos de diversas fuentes para un periodo reciente y hacer distintos analisis espaciales en las cinco zonas endemicas identificadas. La informacion generada se organizo en fichas que sintetizan el panorama en cada zona endemica y permiten hacerse una idea de la vulnerabilidad de la poblacion en riesgo, la incidencia por tipo de infeccion, las especies del vector que se han reportado y las condiciones climaticas predominantes. Si bien, los resultados presentados ofrecen una mirada estatica de un periodo especifico, la base de datos espacial desarrollada permite el ingreso periodico de datos para el seguimiento de la enfermedad que permitan evaluar oportunamente la efectividad de las estrategias adoptadas para la disminucion de la incidencia. Abstract: Malaria is a preventable disease that persists as one of Colombia’s major public health problems. An efficient allocation of resources for malaria control requires the identification of endemic zones and their simultaneous and systematic characterization in several aspects. Geographic Information Systems (GIS) technology was used to bring together data from different sources for a recent period and develop various spatial analyses in the five endemic zones identified. Information was organized in synthesis cards that allow general view of each endemic zone, making it easier to have a general idea about the conditions of vulnerability of population at risk, incidence for each infection type, reported vector species and predominant climatic characteristics. Although results presented constitute a fixed view of the analyzed period, the spatial database developed permits the updating of data in order to track the disease that permits an opportune evaluation of the effectiveness of incidence reduction strategies.