Detectamos la presencia de zoosporas del hongo patogeno Batrachochytrium dendrobatidis (Longcore et al. 1999) en la pielde anfibios encontrados en 3 localidades de los departamentos de Boyaca y Cundinamarca, Colombia. De 336 individuos muestreados, 3fueron positivos a la presencia del patogeno, los cuales pertenecen a las familias Leptodactylidae y Hylidae. Este trabajo es el primer reportede deteccion y cuantificacion de zoosporas de B. dendrobatidis en el pais utilizando la tecnica de PCR en tiempo real (qPCR), donde losresultados obtenidos evidenciaron una baja carga fungica en los anuros positivos a la presencia del hongo. Palabras Clave: Quitridiomicosis, PCR en Tiempo Real, Boyaca, Cundinamarca. Abstract Detection and quantification ofBatrachochytrium dendrobatidis in amphibians of the Central and Eastern Andean, Orinoco and Amazon regions of Colombia Wedetected the presence of zoospores from the amphibian fungal pathogen Batrachochytrium dendrobatidis in amphibians from 3 sites in theBoyaca and Cundinamarca departments of Colombia. Of the 336 individuals sampled, 3 tested positive for the presence of the pathogen;these belong to the Leptodactylidae and Hylidae families. This work is the first report of detection and quantification of zoospores of B.dendrobatidis in the country using the PCR technique in real time, where the results obtained showed a low fungal burden in the anuranpositive for the presence of the fungus. Key words: Chytridiomicosis, Real Time PCR, Boyaca, Cundinamarca.