Capsicum sp. es una especie nativa de America de gran importancia por su diversidad de usos. La Amazonia colombiana es considerada uno de los centros de origen y alberga una gran riqueza de morfoespecies. A pesar de su importancia para el crecimiento y supervivencia de plantas bajo condiciones limitantes de nutrientes, son escasos los trabajos relacionados con la dinamica de los hongos formadores de micorriza arbuscular (HFMA) en Capsicum . Se estudio la ocurrencia de HFMA, a partir de colecta de rizosferas y raices de aji en diferentes rutas. La colonizacion se evaluo por medio de la metodologia de Phillips y Hayman (1970), con modificaciones de Sieverding (1983). El aislamiento y cuantificacion de esporas por la tecnica de Gerdeman y Nicolson (1963), modificada por Sieverding (1983). La asignacion de generos se realizo a partir de la descripcion morfologica de esporas. Todas las plantulas de aji muestreadas presentaron asociaciones con HFMA. Caracteristicas quimicas del suelo, presencia de otras especies vegetales en chagras, fuente de colecta y especies del genero Capsicum incidieron en una alta o baja alta ocurrencia de la simbiosis micorricica. Se identificaron nueve morfotipos de endomicorrizas; Glomus sp. fue el de mayor ocurrencia.